Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk2bP67871 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2bP67871 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms