Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barhl1P63157 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms