Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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