Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps13P62301 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps13P62301 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms