Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd6P61407 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd6P61407 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms