Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem258P61166 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem258P61166 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms