Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah1aP61092 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah1aP61092 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms