Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfia3P60469 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms