Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrnp1P59054 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp1P59054 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms