Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm2P58774 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms