Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpdl3bP58242 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpdl3bP58242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms