Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NcstnP57716 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NcstnP57716 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms