Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn18P56857 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn18P56857 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn18P56857 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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