Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdcd5P56812 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms