Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fdft1P53798 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms