Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgd1P52734 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fgd1P52734 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgd1P52734 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms