Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RorcP51450 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RorcP51450 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorcP51450 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RorcP51450 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RorcP51450 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RorcP51450 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RorcP51450 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorcP51450 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorcP51450 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms