Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx2P48031 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms