Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl36P47964 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl36P47964 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms