Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgavP43406 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgavP43406 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms