Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elk1P41969 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elk1P41969 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms