Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tac1P41539 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tac1P41539 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tac1P41539 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tac1P41539 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms