Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VhlP40338 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VhlP40338 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VhlP40338 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VhlP40338 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VhlP40338 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VhlP40338 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VhlP40338 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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