Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ThpoP40226 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ThpoP40226 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ThpoP40226 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms