Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik2P39087 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms