Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms