Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoc1P34928 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms