Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd28P31041 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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