Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria2P23819 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria2P23819 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms