Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klra1P20937 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klra1P20937 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klra1P20937 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms