Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrkcaP20444 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcaP20444 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms