Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl13aP19253 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms