Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnc1P19123 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms