Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18529 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18529 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18529 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18529 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18529 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18529 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18529 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18529 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms