Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgfb3P17125 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgfb3P17125 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms