Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P10404 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P10404 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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P10404 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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P10404 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P10404 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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P10404 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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P10404 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P10404 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P10404 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P10404 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P10404 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P10404 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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