Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb6P09023 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb6P09023 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms