Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa1P09022 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa1P09022 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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