Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefmP08553 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NefmP08553 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefmP08553 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefmP08553 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefmP08553 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefmP08553 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefmP08553 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefmP08553 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NefmP08553 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NefmP08553 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefmP08553 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms