Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P06323 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P06323 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P06323 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P06323 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P06323 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06323 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06323 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms