Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgfb1P04202 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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