Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtnd1P03888 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtnd1P03888 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms