Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Ab1P01921 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Ab1P01921 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms