Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna1P01572 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna1P01572 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms