Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CcnkO88874 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcnkO88874 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms