Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn2O88703 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms