Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Mmp23O88676 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mmp23O88676 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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