Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51dO55230 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad51dO55230 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms