Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap2O55126 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms