Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg2O55111 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg2O55111 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms